Одной из проблем является набор воды в котловане при монтаже. Для решения этой проблемы вода либо вычерпывается, либо откачивается насосом. Однако, это может замедлить процесс монтажа и увеличить его стоимость. Другой проблемой является обваливание стенок котлована, которое может потребовать дополнительных затрат на укрепление опалубкой. Третья проблема связана с возможностью всплытия самого септика. В случае всплытия, септик необходимо будет выкапывать и переустанавливать.
Кроме того, при неправильной установке поле фильтрации или дренажный колодец могут быть подтоплены, что приведет к тому, что вода не будет уходить в грунт, а, соответственно, не будет осуществляться необходимая доочистка стоков. Высокими грунтовыми водами считаются воды, чья глубина составляет полтора метра и более от поверхности земли. Важно отличать высокие грунтовые воды от поверхностных вод на нефильтрующем грунте. Если на участке присутствует только верховодка и уровень грунтовых вод низкий, можно отводить стоки в фильтрующий колодец.
Чтобы определить, фильтрует ли грунт и как высоко находятся грунтовые воды, рекомендуется провести пробное бурение. Это лучше сделать перед строительством дома. Также можно выкопать яму и проверить, набирается ли в ней вода. Если вода набирается, то грунт фильтрующий и уровень грунтовых вод высокий. Если яма остается сухой, а вода появляется только после дождя, значит грунт не фильтрующий и задерживает воду. Определить уровень воды можно самому, но лучше вызвать инженера-замерщика, который сможет выяснить особенности грунта и подобрать подходящую модель септика. Для высоких грунтовых вод и/или глинистых грунтов подходят следующие типы септиков: септик с принудительным отводом в фильтрующую кассету, септик с фильтрующей траншеей, септик с биофильтром и станция биологической очистки с принудительной откачкой. Септик с обычным полем фильтрации или колодцем не подходит для высокого уровня грунтовых вод, так как фильтрующая засыпка будет находиться в воде, что не позволит стокам фильтроваться и впитываться в почву.
Надо отметить, что септики-отстойники предназначены для механической очистки стоков. Масла, жиры и легкие взвеси всплывают в камерах септика, а частицы более тяжелые оседают. Анаэробное брожение также вносит свой вклад в очистку стоков. Однако, по заявлениям производителей, стоки очищаются только на 90% от взвесей и на 50-60% от органики. Согласно СНиП, септик является лишь незавершенным очистным сооружением, и после его использования стоки нужно отводить на почвенную фильтрацию. Это означает, что вода должна просачиваться через слой щебня, доочищаться бактериями и уходить в грунт. Но если уровень грунтовых вод высокий, фильтрующее сооружение окажется в воде, и доочистку следует делать выше уровня грунтовых вод. Два основных варианта доочистки стоков — фильтрующая траншея и фильтрующая кассета.